学院各本科专业通过企业深度参与人才培养的各个环节，从培养计划制定、校企联合课程，到企业实践、研究生联合培养、教师践习，构建了一套立体化、全方位的校企联合人才培养方式，实现了学校培养向企业后延、企业人力资源向学校前伸。学生通过在企业分阶段、分层次的专业实践，熟悉学科领域的基本方法，提高综合运用知识的能力;了解工程实际需要，培养职业素养、分析能力、沟通表达能力、团结协作能力、管理能力等工程综合能力。与中国长江三峡集团培训中心、新疆吉农土地勘测规划设计院有限公司、新疆克孜尔水库管理局、塔里木河流域干流管理局上游管理处、廊坊市城乡规划设计研究院新疆分院、新疆宏盛牧歌养殖有限公司、阿拉尔市生态环境局、一市生态环境监测站、阿克苏地区人工影响天气办公室、阿拉尔市生活垃圾填埋场、阿克苏环保集团有限公司、阿拉尔方正检测有限公司、艾特克水务有限公司、深圳国晟设计有限公司、新疆疆海测绘院等40余家企事业单位开展了广泛深入的产、学、研合作。另外，与中国地质大学（武汉）环境学院、浙江大学、东华大学、中国科学院西北生态环境资源研究院、石河子大学、新疆大学、喀什大学建立可持续的合作关系，在人才联合培养、学科建设、科研项目联合申报方面开展了广泛的合作交流。
